Η διοργάνωση ξεκίνησε στις 18 Αυγούστου 2025 με τον Προκριματικό Γύρο στην οποία συμμετείχαν οι ομάδες της Σούπερ Λιγκ 2, οι ομάδες που κατέλαβαν τις θέσεις 9 έως 12 της Σούπερ Λιγκ 1 της προηγούμενης σεζόν και οι δύο ομάδες που κέρδισαν την άνοδο στην Σούπερ Λιγκ την περίοδο 2024–25, ενώ θα ολοκληρωθεί με τη διεξαγωγή του τελικού στις 25 Απριλίου 2026.

Η φετινή διοργάνωση αποτελεί την πρώτη εφαρμογή ενός νέου συστήματος διεξαγωγής, το οποίο περιλαμβάνει Προκριματικό Γύρο, League Phase, Play offs Προημιτελικούς, Ημιτελικούς και Τελικό, προσαρμόζοντας τη μορφή του θεσμού σε ευρωπαϊκά πρότυπα. Επιπλέον, καταργείται η παράταση στους αγώνες έως και τους Ημιτελικούς, ενώ κάθε ομάδα υποχρεούται να έχει στην αρχική ενδεκάδα τουλάχιστον έναν παίκτη γεννημένο από το 2004 και μετά.

O νικητής του Κυπέλλου Ελλάδας 2025–26, έχει δικαίωμα συμμετοχής στον τρίτο προκριματικό γύρο του ΟΥΕΦΑ Γιουρόπα Λιγκ 2026–27. Θα συμμετάσχει επίσης στο Σούπερ Καπ Ελλάδας 2026.

Χθες διεξήχθη ο πρώτος αγώνας για τον θεσμό του κυππέλου και ακολουθούν σημερα οι υπόλοιποι: